國家發展改革委員會會同農業部制定了《全國畜禽糞污資源化利用整縣推進項目工作方案（2018-2020年）》，整合中央投資專項，重點支持畜牧大縣整縣推進畜禽糞污資源化利用。全國畜牧總站組織征集畜禽糞污資源化利用典型技術模式，在全國共收集了29個省239種技術模式，經專家篩選評審，總結提煉出種養結合、清潔回用及達標排放3個方面9種畜禽糞污資源化利用主推技術模式。
         一、種養結合
        1、糞污全量還田模式對養殖場產生的糞便、糞水和污水集中收集，全部進入氧化塘貯存，氧化塘分為敞開式和覆膜式兩類，糞污通過氧化塘貯存進行無害化處理，在施肥季節進行農田利用。
        主要優點：糞污收集、處理、貯存設施建設成本低，處理利用費用也較低；糞便、糞水和污水全量收集，養分利用率高。主要不足：糞污貯存周期一般要達到半年以上，需要足夠的土地建設氧化塘貯存設施；施肥期較集中，需配套專業化的攪拌設備、施肥機械、農田施用管網等；糞污長距離運輸費用高，只能在一定范圍內施用。適用范圍：適用于豬場水泡糞工藝或奶牛場的自動刮糞回沖工藝，糞污的總固體含量小于15；需要與糞污養分量相配套的農田。
        2、糞便堆肥利用模式（包括條垛式、槽式、筒倉式、高（低）架發酵床、異位發酵床）以生豬、肉牛、蛋雞、肉雞和羊規模養殖場的固體糞便為主，經好氧堆肥無害化處理后，就地農田利用或生產有機肥。主要優點：好氧發酵溫度高，糞便無害化處理較干凈，發酵周期短；堆肥處理提高糞便的附加值。主要不足：好氧堆肥過程易產生大量的臭氣。適用范圍：適用于只有固體糞便、無污水產生的家禽養殖場或羊場等。
        3、糞水肥料化利用模式養殖場產生的糞水經氧化塘處理儲存后，在農田需肥和灌溉期間，將無害化處理的糞水與灌溉用水按照一定的比例混合，進行水肥一體化施用。主要優點：糞水進行氧化塘無害化處理后，為農田提供有機肥水資源，解決糞水處理壓力。主要不足：要有一定容積的貯存設施，周邊配套一定農田面積；需配套建設糞水輸送管網或購置糞水運輸車輛。適用范圍：適用于周圍配套有一定面積農田的畜禽養殖場，在農田作物灌溉施肥期間進行水肥一體化施用。
        4、糞污能源化利用模式（含沼渣、沼液、沼氣）以專業生產可再生能源為主要目的，依托專門的畜禽糞污處理企業，收集周邊養殖場糞便和糞水，投資建設大型沼氣工程，進行厭氧發酵，沼氣發電上網或提純生物天然氣，沼渣生產有機肥農田利用，沼液農田利用或深度處理達標排放。主要優點：對養殖場的糞便和糞水集中統一處理，減少小規模養殖場糞污處理設施的投資；專業化運行，能源化利用效率高。主要不足：一次性投資高；能源產品利用難度大；沼液產生量大集中，處理成本較高，需配套后續處理利用工藝。適用范圍：適用于大型規模養殖場或養殖密集區，具備沼氣發電上網或生物天然氣進入管網條件，需要地方政府配套政策予以保障。
        二、清潔回用
        5、糞便基質化利用模式以畜禽糞污、菌渣及農作物秸稈等為原料，進行堆肥發酵，生產基質盤和基質土應用于栽培果菜。主要優點：畜禽糞污、食用菌廢棄菌渣、農作物秸稈三者結合，科學循環利用，實現農業生產鏈零廢棄的生態循環生產，形成一個有機循環農業綜合經濟體系，提高資源綜合利用率。主要不足：生產鏈較長，精細化技術程度高，要求生產者的整體素質高，培訓期實習期較長。適用范圍：該模式既適用大中型生態農業企業，又適合小型農村家庭生態農場，同時適合小型農村家庭農場分工、聯合經營。
        6、糞便墊料化利用模式基于奶牛糞便纖維素含量高、質地松軟的特點，將奶牛糞污固液分離后，固體糞便進行好氧發酵無害化處理后回用作為牛床墊料，污水貯存后作為肥料進行農田利用。 主要優點：牛糞替代沙子和土作為墊料，減少糞污后續處理難度。主要不足：作為墊料如無害化處理不干凈，可能存在一定的生物安全風險。適用范圍：適用于規模奶牛場。
        7、糞便飼料化利用模式（主要養殖蚯蚓、蠅蛆、黑水虻等）畜禽養殖過程中的干清糞與蚯蚓、蠅蛆及黑水虻等動物蛋白進行堆肥發酵，生產有機肥用于農業種植，發酵后的蚯蚓、蠅蛆及黑水虻等動物蛋白用于制作飼料等。主要優點：改變了傳統利用微生物進行糞便處理的理念，可以實現集約化管理，成本低、資源化效率高，無二次排放及污染，實現生態養殖。主要不足：動物蛋白飼養溫度、濕度、養殖環境的透氣性要求高，要防止鳥類等天敵的偷食。適用范圍：適用于遠離城鎮，養殖場有閑置地，周邊有農田，農副產品較豐富的中、大規模養殖場。
        8、糞便燃料化利用模式（生物干化、生物質壓塊燃料）畜禽糞便經過攪拌后脫水加工，進行擠壓造粒，生產生物質燃料棒。主要優點：畜禽糞便制成生物質環保燃料，作為替代燃煤生產用燃料，成本比燃煤價格低，減少二氧化碳和二氧化硫排放量。主要不足：糞便脫水干燥能耗較高。適用范圍：適用于城市和工業燃煤需求量較大的地區。
        三、達標排放
        9、糞水達標排放模式養殖場產生的糞水進行厭氧發酵+好氧處理等組合工藝進行深度處理，糞水達到《畜禽養殖業污染物排放標準》(GB18596-2001，其中COD低于400mg/L，NH3-N低于80mg/L，TP低于8mg/L)或地方標準后直接排放，固體糞便進行堆肥發酵就近肥料化利用或委托他人進行集中處理。主要優點：糞水深度處理后，實現達標排放;不需要建設大型糞水貯存池，可減少糞污貯存設施的用地。主要不足：糞水處理成本高，大多養殖場難承受。適用范圍：適用于養殖場周圍沒有配套農田的規模化豬場或奶牛場。